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实验室里的“水家族”:从自来水、双蒸水、超纯水到DEPC水,各有神通

更新时间:2025-12-01      点击次数:30

走进生物或化学实验室,我们会发现“水”的身影无处不在,但它们不只是我们日常饮用的自来水。这个庞大的“水家族”成员众多,纯度各异,就像不同岗位的技术员,各自承担着它们的专属使命。从清洁器皿到精准实验,它们的“能力”差异直接影响着实验的成败。

入门级成员:自来水——实验室的“勤杂工”

作为“水家族”的基础成员,自来水就是我们日常生活中使用的市政供水,未经过特殊纯化处理。它带着天然的矿物质、微量微生物,还有水厂消毒残留的氯,水质会随地域和季节波动,稳定性较差。

自来水虽然登不上精密实验的”舞台“,但却是实验室不可或缺的“勤杂工”。仪器冷却、实验台清洁、玻璃器皿的初步冲洗,但凡是这些不需要高纯度的活儿,都由它来高效完成,既经济又实用。

进阶级成员:双蒸水(ddH2O)与纯水(Pure Water)——常规实验的“得力助手”

当实验对水的纯度有了基本要求,双蒸水和纯水就该登场了。双蒸水是经过两次蒸馏得到的水,在经历“双重过滤”后,大部分杂质、微生物和离子被去除,纯度远超自来水,但仍会残留少量有机物和微量元素,胜就胜在成本较低。


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纯水则是通过反渗透、离子交换等现代工艺纯化的水,电导率控制在1-10μS/cm,不含明显可见杂质。相比双蒸水,它的纯化过程更高效,纯度也更稳定。

这两位”助手“包揽了实验室的常规工作:溶液配制、样品稀释、普通化学实验,以及精密仪器的初步清洗,是支撑实验室日常运转的中坚力量。

精英级成员:超纯水(Ultrapure Water,UPW)——精密实验的“核心骨干”

对于HPLC(高效液相色谱)、ICP(电感耦合等离子体)分析这类需要“火眼金睛”的精密实验,只有超纯水能够胜任。超纯水经历了反渗透、离子交换、UV杀菌、滤膜过滤等多重考验,电导率≤0.055 μS/cm,几乎不含任何离子、微生物和有机物。

在分子生物学实验室,超纯水更是“明星级”的存在:细胞培养时,它能为细胞提供无菌无毒的环境;核酸提取中,它不会干扰核酸的分离与纯化。可以说,超纯水的纯度,直接决定了精密实验结果的准确性。

特种成员:DEPC水(DEPC-Treated Water)与无酶水(Enzyme-Free Water)——核酸实验的“守护使者”

在RNA、DNA相关实验中,最可怕的“敌人”是核酸酶——这些藏在水中的“破坏者”会悄悄降解核酸,让实验功亏一篑。这时,DEPC水和无酶水这两位“守护使者”就派上用场了。

DEPC水是用超纯水溶解DEPC(焦碳酸二乙酯)后,再经高压灭菌制成的。DEPC能高效灭活RNA酶、DNA酶和蛋白酶,就像给核酸穿上了“防护衣”,特别适合RNA提取、RT-PCR等对RNA酶敏感的实验。

DEPC是一种强效的烷基化试剂,其灭活RNA酶的核心机制是通过共价修饰 RNA酶活性中心的亲核基团,从而不可逆地破坏其催化活性。其具体的作用机制主要作用于酶蛋白分子中的组氨酸残基的咪唑环,其次是半胱氨酸的巯基(-SH)、赖氨酸的氨基(-NH₂) 以及酪氨酸的酚羟基。这些基团在RNA酶的活性中心通常作为亲核试剂或广义碱/酸,参与RNA底物磷酸二酯键的切割。

DEPC的乙氧甲酰基(-COOCH₂CH₃)会与上述亲核基团(以组氨酸为例)发生乙氧甲酰化反应。反应式可以简化为:组氨酸-Imidazole-NH + DEPC → 组氨酸-Imidazole-N-COO-Ethyl + CO₂ + EtOH,这个反应在咪唑环的氮原子上引入了一个庞大的乙氧甲酰基团。这个修饰改变了组氨酸等关键残基的化学性质和空间构象。它直接破坏了RNA酶活性中心的精密结构,使其无法再有效地结合底物(RNA)和催化水解反应。由于是共价修饰,这种失活是不可逆的。

同样的,DEPC可以通过修饰DNA酶活性中心的必需氨基酸残基而使其失活。但由于RNA酶极其稳定且无处不在,是RNA操作中的头号敌人,因此DEPC的讨论通常集中在灭活RNA酶上。



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RNA酶


无酶水则是专门去除了核酸酶的高纯度水,它未必经过DEPC处理,核心优势是“无核酸酶污染”。在DNA提取、PCR扩增、质粒构建等实验中,它能确保DNA不被降解,使实验顺利进行。

水的“选择密码”:匹配需求才是关键

实验室的“水家族”没有绝对的高低贵贱之分,只有适不适合之说。清洗烧杯等玻璃器皿用自来水就足够,配制PCR试剂却必须用无酶水;普通化学实验用纯水经济高效,而质谱分析则离不开超纯水。

这些看似普通的水,承载着实验的严禁与精准。了解它们的特性,选对每一种水,正是科研工作者迈出的扎实第一步-毕竟,再精密的实验,也需要从“一瓶好水”开始。



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参考文献

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[2] Sambrook, J., & Russell, D. W. (2001). Molecular Cloning: A Laboratory Manual (3rd ed.). Cold Spring Harbor Laboratory Press.


[3] Henderson, R. E., Kirkegaard, L. H., & Leonard, N. J. (1973). Reaction of diethyl pyrocarbonate with nucleic acid components. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Nucleic Acids and Protein Synthesis, 294(1), 24-37.


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